Regen spült losen Staub ab. Vogelkot, ein Film aus Pollen und festsitzender Schmutz bleiben aber oft haften. Am unteren Rand der Module, wo das Wasser abläuft, kann sich der Schmutz sogar sammeln. Flach geneigte Module reinigen sich schlechter selbst als steile.
Jeder Belag nimmt den Zellen Licht, und schon einzelne Flecken wie Vogelkot verschatten Teile eines Moduls. Die Anlage liefert dann weniger Strom, als sie könnte, oft ohne dass man es von unten sieht. Anlagen auf landwirtschaftlichen Gebäuden sind durch Staub, Pollen und Vogelkot häufig stärker belastet.